MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia sp. RPE64 DNA

Total Repeats: 23244

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021288	CGC	2	6	6	11	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_021288	CGAT	2	8	14	21	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_021288	CGT	2	6	35	40	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_021288	TGC	2	6	53	58	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_021288	ACG	2	6	97	102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_021288	GCG	2	6	112	117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_021288	CGG	2	6	118	123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_021288	GAC	2	6	136	141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_021288	ATCG	2	8	164	171	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_021288	GT	3	6	200	205	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021288	GAC	2	6	285	290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_021288	ACG	2	6	307	312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507517442
13	NC_021288	AGCG	2	8	314	321	25 %	0 %	50 %	25 %	507517442
14	NC_021288	T	6	6	327	332	0 %	100 %	0 %	0 %	507517442
15	NC_021288	CCG	2	6	356	361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507517442
16	NC_021288	GC	3	6	420	425	0 %	0 %	50 %	50 %	507517442
17	NC_021288	TGC	2	6	442	447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507517442
18	NC_021288	GC	3	6	529	534	0 %	0 %	50 %	50 %	507517442
19	NC_021288	GAC	2	6	596	601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507517442
20	NC_021288	GGC	2	6	614	619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507517442
21	NC_021288	GCG	2	6	622	627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507517442
22	NC_021288	GCT	2	6	647	652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507517442
23	NC_021288	GC	3	6	682	687	0 %	0 %	50 %	50 %	507517442
24	NC_021288	GCG	3	9	700	708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507517442
25	NC_021288	GGC	2	6	713	718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507517442
26	NC_021288	CG	3	6	739	744	0 %	0 %	50 %	50 %	507517442
27	NC_021288	CTA	2	6	767	772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507517442
28	NC_021288	CGG	2	6	773	778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507517442
29	NC_021288	GTC	2	6	800	805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507517442
30	NC_021288	ATC	2	6	807	812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507517442
31	NC_021288	TGC	2	6	826	831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507517442
32	NC_021288	GTGG	2	8	857	864	0 %	25 %	75 %	0 %	507517442
33	NC_021288	GTC	2	6	894	899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507517442
34	NC_021288	GC	3	6	905	910	0 %	0 %	50 %	50 %	507517442
35	NC_021288	CGG	2	6	915	920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507517442
36	NC_021288	GGC	2	6	926	931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507517442
37	NC_021288	CGG	2	6	974	979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507517442
38	NC_021288	AGC	2	6	985	990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507517442
39	NC_021288	GCT	2	6	1024	1029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507517442
40	NC_021288	TCG	2	6	1063	1068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507517442
41	NC_021288	TGC	2	6	1072	1077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507517442
42	NC_021288	GGT	2	6	1100	1105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	507517442
43	NC_021288	GTG	2	6	1140	1145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	507517442
44	NC_021288	GC	3	6	1149	1154	0 %	0 %	50 %	50 %	507517442
45	NC_021288	GCG	2	6	1183	1188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507517442
46	NC_021288	GCT	2	6	1214	1219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507517442
47	NC_021288	GAT	2	6	1244	1249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507517442
48	NC_021288	CGA	2	6	1318	1323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507517442
49	NC_021288	TCG	2	6	1408	1413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507517442
50	NC_021288	GTT	2	6	1419	1424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	507517442
51	NC_021288	CG	3	6	1456	1461	0 %	0 %	50 %	50 %	507517442
52	NC_021288	TGC	2	6	1483	1488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507517442
53	NC_021288	GGC	2	6	1505	1510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507517442
54	NC_021288	TCT	2	6	1596	1601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	507517443
55	NC_021288	TGT	2	6	1662	1667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	507517443
56	NC_021288	CG	3	6	1683	1688	0 %	0 %	50 %	50 %	507517443
57	NC_021288	ACGA	2	8	1733	1740	50 %	0 %	25 %	25 %	507517443
58	NC_021288	CTTGGC	2	12	1816	1827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507517443
59	NC_021288	TGG	2	6	1848	1853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	507517443
60	NC_021288	GCG	2	6	1885	1890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507517443
61	NC_021288	TCG	2	6	1904	1909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507517443
62	NC_021288	AGC	2	6	1910	1915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507517443
63	NC_021288	CG	3	6	1992	1997	0 %	0 %	50 %	50 %	507517443
64	NC_021288	CGTC	2	8	2064	2071	0 %	25 %	25 %	50 %	507517443
65	NC_021288	TCG	2	6	2075	2080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507517443
66	NC_021288	GCA	3	9	2133	2141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507517443
67	NC_021288	GC	4	8	2165	2172	0 %	0 %	50 %	50 %	507517443
68	NC_021288	CTT	2	6	2188	2193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	507517443
69	NC_021288	CGGC	2	8	2223	2230	0 %	0 %	50 %	50 %	507517443
70	NC_021288	CTT	2	6	2311	2316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	507517443
71	NC_021288	CG	5	10	2434	2443	0 %	0 %	50 %	50 %	507517443
72	NC_021288	AGCGAA	2	12	2444	2455	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	507517443
73	NC_021288	TGA	2	6	2514	2519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507517443
74	NC_021288	AC	3	6	2539	2544	50 %	0 %	0 %	50 %	507517443
75	NC_021288	CAG	2	6	2572	2577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507517443
76	NC_021288	CG	6	12	2643	2654	0 %	0 %	50 %	50 %	507517443
77	NC_021288	AGT	2	6	2721	2726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507517443
78	NC_021288	GTC	2	6	2755	2760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507517443
79	NC_021288	TGG	2	6	2781	2786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	507517443
80	NC_021288	CGA	2	6	2787	2792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507517443
81	NC_021288	CGC	2	6	2800	2805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507517443
82	NC_021288	GC	3	6	2818	2823	0 %	0 %	50 %	50 %	507517443
83	NC_021288	CCG	2	6	2837	2842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507517443
84	NC_021288	TGT	2	6	2856	2861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	507517443
85	NC_021288	TCG	2	6	2883	2888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507517443
86	NC_021288	GCT	2	6	2943	2948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507517443
87	NC_021288	TTG	2	6	2965	2970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	507517443
88	NC_021288	GCC	2	6	3093	3098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507517444
89	NC_021288	A	6	6	3275	3280	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021288	TTGAG	2	10	3426	3435	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021288	GTGA	2	8	3447	3454	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021288	A	6	6	3493	3498	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021288	CCTA	2	8	3643	3650	25 %	25 %	0 %	50 %	507517445
94	NC_021288	ACCGCG	2	12	3742	3753	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	507517445
95	NC_021288	GCA	2	6	3811	3816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507517445
96	NC_021288	GCCGCA	2	12	3879	3890	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	507517445
97	NC_021288	GT	3	6	3912	3917	0 %	50 %	50 %	0 %	507517445
98	NC_021288	GAC	2	6	3991	3996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507517445
99	NC_021288	GGC	2	6	4010	4015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507517445
100	NC_021288	ACC	2	6	4025	4030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	507517445
101	NC_021288	ACG	2	6	4031	4036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507517445
102	NC_021288	CTC	2	6	4061	4066	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	507517445
103	NC_021288	GGCGTC	2	12	4102	4113	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	507517445
104	NC_021288	CGA	2	6	4153	4158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507517445
105	NC_021288	TA	4	8	4172	4179	50 %	50 %	0 %	0 %	507517445
106	NC_021288	CAT	2	6	4243	4248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507517445
107	NC_021288	CAGA	2	8	4294	4301	50 %	0 %	25 %	25 %	507517445
108	NC_021288	TCGC	2	8	4357	4364	0 %	25 %	25 %	50 %	507517445
109	NC_021288	CGTCGC	2	12	4389	4400	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	507517445
110	NC_021288	GCT	2	6	4423	4428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507517445
111	NC_021288	GAT	2	6	4453	4458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507517445
112	NC_021288	TCA	2	6	4476	4481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507517445
113	NC_021288	GTT	2	6	4501	4506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	507517445
114	NC_021288	GGA	2	6	4519	4524	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	507517445
115	NC_021288	TCC	2	6	4527	4532	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	507517445
116	NC_021288	GAA	2	6	4538	4543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507517445
117	NC_021288	TGT	2	6	4572	4577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	507517445
118	NC_021288	CGT	2	6	4599	4604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507517445
119	NC_021288	GGT	2	6	4612	4617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	507517445
120	NC_021288	GTC	2	6	4724	4729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507517445
121	NC_021288	GAT	2	6	4774	4779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507517445
122	NC_021288	GAT	2	6	4799	4804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507517445
123	NC_021288	TCA	2	6	4809	4814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507517445
124	NC_021288	CAA	2	6	4839	4844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	507517446
125	NC_021288	AAG	2	6	4912	4917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507517446
126	NC_021288	GCC	2	6	4969	4974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507517446
127	NC_021288	TCGAG	2	10	4997	5006	20 %	20 %	40 %	20 %	507517446
128	NC_021288	TCGAT	2	10	5030	5039	20 %	40 %	20 %	20 %	507517446
129	NC_021288	GCT	2	6	5121	5126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507517446
130	NC_021288	TCG	2	6	5142	5147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507517446
131	NC_021288	GCGA	2	8	5177	5184	25 %	0 %	50 %	25 %	507517446
132	NC_021288	GC	4	8	5190	5197	0 %	0 %	50 %	50 %	507517446
133	NC_021288	GGT	2	6	5229	5234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	507517446
134	NC_021288	CG	3	6	5288	5293	0 %	0 %	50 %	50 %	507517446
135	NC_021288	CGGAGT	2	12	5336	5347	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	507517446
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257	NC_021288	CGCA	2	8	10717	10724	25 %	0 %	25 %	50 %	507517449
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263	NC_021288	GC	3	6	10969	10974	0 %	0 %	50 %	50 %	507517449
264	NC_021288	GTC	2	6	10994	10999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507517449
265	NC_021288	GATACG	2	12	11002	11013	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	507517449
266	NC_021288	TCG	2	6	11016	11021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507517449
267	NC_021288	GGCG	2	8	11039	11046	0 %	0 %	75 %	25 %	507517449
268	NC_021288	CGC	2	6	11047	11052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507517449
269	NC_021288	CGGG	2	8	11118	11125	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
270	NC_021288	AAGC	2	8	11254	11261	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
271	NC_021288	CG	3	6	11283	11288	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
272	NC_021288	CG	3	6	11424	11429	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
273	NC_021288	GCA	2	6	11589	11594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507517450
274	NC_021288	CGGC	2	8	11599	11606	0 %	0 %	50 %	50 %	507517450
275	NC_021288	CTG	2	6	11607	11612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507517450
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277	NC_021288	GGC	2	6	11664	11669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507517450
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319	NC_021288	ATC	2	6	13120	13125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507517454
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370	NC_021288	TC	3	6	14978	14983	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
371	NC_021288	GC	3	6	14987	14992	0 %	0 %	50 %	50 %	507517456
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391	NC_021288	CCGCG	2	10	15510	15519	0 %	0 %	40 %	60 %	507517456
392	NC_021288	CGT	2	6	15579	15584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507517456
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396	NC_021288	CGT	3	9	15663	15671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507517456
397	NC_021288	CGA	2	6	15718	15723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507517456
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399	NC_021288	GCGG	2	8	15811	15818	0 %	0 %	75 %	25 %	507517456
400	NC_021288	GC	3	6	15828	15833	0 %	0 %	50 %	50 %	507517456
401	NC_021288	CGC	2	6	15969	15974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507517457
402	NC_021288	GC	3	6	16017	16022	0 %	0 %	50 %	50 %	507517457
403	NC_021288	GCCG	2	8	16057	16064	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
404	NC_021288	ACGA	2	8	16092	16099	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
405	NC_021288	CGC	2	6	16145	16150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507517458
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479	NC_021288	ACCT	2	8	18847	18854	25 %	25 %	0 %	50 %	507517461
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497	NC_021288	ACC	2	6	19422	19427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	507517462
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